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アクセス解析のHTMLコードをCGI(及びプログラム)に組み込んでも解析は可能でしょうか?

基本的にどんなCGIでも最終的にはHTMLコードを書き出します。
この最終的に書き出されるHTMLコード中に正しくアクセス解析ソースが含まれていればCGIのページでもアクセス解析を行うことが可能です。

ですが、ブログ等の動的プログラムの場合、アクセス解析で使用するソースの一部を許可していない、または制限しているものがあります。
その為、動作や解析結果は保証できかねます。