『忍者ホームページ』で、3ヶ月以上更新なしだった場合に表示される広告を消去するため、ホームページを更新しても、広告が表示されたままである場合には、以下の可能性が考えられます。

広告ソースのついたHTMLを更新してはいませんか？

• 広告が表示されたHTMLをブラウザからダウンロードした
• 広告が表示されたHTMLのソースを開いてソースをコピペした

など、気付かないうちに広告タグごと更新していませんか？

『更新なし広告』は、ホームページを表示した際に自動挿入されます。
そのため、ブラウザで表示されたものをダウンロードしたり、ソースを保存したりすると、自動挿入された広告タグごと保存してしまうことになります。
広告タグごと保存されたHTMLは、広告タグを削除しない限り、どれだけ更新しても広告が消えることがありません。
お手元にオリジナルのHTMLがない場合でも、更新なしの広告が出た場合は、ブラウザからダウンロードしたり、ソースを保存したりせず、自分のパソコンに保存してあるHTMLを利用して更新してください。
ホームページ用のHTMLがなんらかの理由で手元にない場合、必ずFTPで接続し、サーバー側にアップロードされているHTMLを利用して更新してください。

『3ヶ月更新がなかった場合に表示される広告』は、有料プランでは表示されません。
広告が気になる場合は有料プランをご検討ください。

キャッシュが残ってはいませんか？

すでに広告は消えているのに、ブラウザ側・サーバー側のキャッシュのため、広告が表示されているかのように見えることがあります。
ブラウザの履歴をクリアして、Ctrl＋F5を押し、強制的に再読み込みすることをおためしください。